Гистондеацетилаза 11

Гистондеацетилаза 11
Идентификаторы
ПсевдонимыHDAC11, HD11, histone deacetylase 11
Внешние IDOMIM: 607226 MGI: 2385252 HomoloGene: 11743 GeneCards: HDAC11
Расположение гена (человек)
3-я хромосома человека
Хр.3-я хромосома человека[1]
3-я хромосома человека
Расположение в геноме HDAC11
Расположение в геноме HDAC11
Локус3p25.1Начало13,479,724 bp[1]
Конец13,506,424 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
6-я хромосома мыши
Хр.6-я хромосома мыши[2]
6-я хромосома мыши
Расположение в геноме HDAC11
Расположение в геноме HDAC11
Локус6|6 D1Начало91,133,647 bp[2]
Конец91,151,674 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • left testis

  • inferior ganglion of vagus nerve

  • right testis

  • C1 segment
Наибольшая экспрессия в
  • dorsomedial hypothalamic nucleus

  • dorsal tegmental nucleus

  • lateral hypothalamus

  • anterior amygdaloid area

  • central gray substance of midbrain

  • Region I of hippocampus proper
Дополнительные справочные данные
BioGPS
Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

79885

232232

Ensembl

ENSG00000163517

ENSMUSG00000034245

UniProt

Q96DB2

Q91WA3

RefSeq (мРНК)

NM_001136041
NM_024827
NM_001330636

NM_144919

RefSeq (белок)

NP_001129513
NP_001317565
NP_079103

NP_659168

Локус (UCSC)Chr 3: 13.48 – 13.51 MbChr 6: 91.13 – 91.15 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

Гистондеацетилаза 11 (англ. Histone deacetylase 11) — фермент массой 39 кДа, кодируеммый у человека геном HDAC11, расположен на хромосоме 3 у человека и на хромосоме 6 у мышей[5][6].

Он является IV классом HDAC. (Класс IV имеют характеристики как класса I, так и класса II HDAC). Впервые он был описан в 2002 году.

Гистондеацетилазы, такие как HDAC11, контролируют экспрессию ДНК путём модификации октамерного ядра гистонов, что упаковывает ДНК в плотные структуры хроматина и подавляют экспрессию генов[6].

Функции

HDAC11 экспрессируется обычно в мозгу и тканях яичка, но повышенная экспрессия HDAC11 также была замечена в различных раковых клетках.

HDAC11 был показан в качестве негативного регулятора производства IL-10 в клетках, представляющих антигены. Кроме того, было выявлено, что ингибирование HDAC11 приводит к повышенной экспрессии OX40L в клетках лимфомы Ходжкина.

Взаимодействия

HDAC11, как было выявлено, взаимодействует с HDAC6[7].

См. также

Примечания

  1. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000163517 - Ensembl, May 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000034245 - Ensembl, May 2017
  3. ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ↑ Gao L., Cueto M.A., Asselbergs F., Atadja P. Cloning and functional characterization of HDAC11, a novel member of the human histone deacetylase family (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2002. — July (vol. 277, no. 28). — P. 25748—25755. — doi:10.1074/jbc.M111871200. — PMID 11948178.
  6. 1 2 Entrez Gene: HDAC11 histone deacetylase 11.
  7. ↑ Gao, Lin; Cueto Maria A; Asselbergs Fred; Atadja Peter. Cloning and functional characterization of HDAC11, a novel member of the human histone deacetylase family (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — United States, 2002. — July (vol. 277, no. 28). — P. 25748—25755. — ISSN 0021-9258. — doi:10.1074/jbc.M111871200. — PMID 11948178.

Литература

  • Verdin E., Dequiedt F., Kasler H.G. Class II histone deacetylases: versatile regulators (англ.) // Trends : journal. — 2003. — Vol. 19, no. 5. — P. 286—293. — doi:10.1016/S0168-9525(03)00073-8. — PMID 12711221.
  • Hartley J.L., Temple G.F., Brasch M.A. DNA Cloning Using In Vitro Site-Specific Recombination (англ.) // Genome Research : journal. — 2001. — Vol. 10, no. 11. — P. 1788—1795. — doi:10.1101/gr.143000. — PMID 11076863. — PMC 310948.
  • Simpson JC; Wellenreuther R; Poustka A; Pepperkok, R; Wiemann, S. Systematic subcellular localization of novel proteins identified by large-scale cDNA sequencing (англ.) // EMBO Reports : journal. — 2001. — Vol. 1, no. 3. — P. 287—292. — doi:10.1093/embo-reports/kvd058. — PMID 11256614. — PMC 1083732.
  • Strausberg RL; Feingold EA; Grouse LH; Derge, JG; Klausner, RD; Collins, FS; Wagner, L; Shenmen, CM; Schuler, G.D. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
  • Ota T; Suzuki Y; Nishikawa T; Otsuki, Tetsuji; Sugiyama, Tomoyasu; Irie, Ryotaro; Wakamatsu, Ai; Hayashi, Koji; Sato, Hiroyuki. Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs (англ.) // Nature Genetics : journal. — 2004. — Vol. 36, no. 1. — P. 40—5. — doi:10.1038/ng1285. — PMID 14702039.
  • Gerhard DS; Wagner L; Feingold EA; Shenmen, CM; Grouse, LH; Schuler, G; Klein, SL; Old, S; Rasooly, R. The Status, Quality, and Expansion of the NIH Full-Length cDNA Project: The Mammalian Gene Collection (MGC) (англ.) // Genome Research : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2121—2127. — doi:10.1101/gr.2596504. — PMID 15489334. — PMC 528928.
  • Wiemann S; Arlt D; Huber W; Wellenreuther, R; Schleeger, S; Mehrle, A; Bechtel, S; Sauermann, M; Korf, U. From ORFeome to Biology: A Functional Genomics Pipeline (англ.) // Genome Research : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2136—2144. — doi:10.1101/gr.2576704. — PMID 15489336. — PMC 528930.
  • Voelter-Mahlknecht S., Ho A.D., Mahlknecht U. Chromosomal organization and localization of the novel class IV human histone deacetylase 11 gene (англ.) // International Journal of Molecular Medicine : journal. — 2005. — Vol. 16, no. 4. — P. 589—598. — doi:10.3892/ijmm.16.4.589. — PMID 16142391.
  • Rual JF; Venkatesan K; Hao T; Hirozane-Kishikawa, Tomoko; Dricot, Amélie; Li, Ning; Berriz, Gabriel F.; Gibbons, Francis D.; Dreze, Matija. Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network (англ.) // Nature : journal. — 2005. — Vol. 437, no. 7062. — P. 1173—1178. — doi:10.1038/nature04209. — PMID 16189514.
  • Mehrle A; Rosenfelder H; Schupp I; Del Val, C; Arlt, D; Hahne, F; Bechtel, S; Simpson, J; Hofmann, O. The LIFEdb database in 2006 (англ.) // Nucleic Acids Research : journal. — 2006. — Vol. 34, no. Database issue. — P. D415—8. — doi:10.1093/nar/gkj139. — PMID 16381901. — PMC 1347501.
  • Lindberg D., Akerström G., Westin G. Mutational analyses of WNT7A and HDAC11 as candidate tumour suppressor genes in sporadic malignant pancreatic endocrine tumours (англ.) // Clin. Endocrinol. (Oxf) : journal. — 2007. — Vol. 66, no. 1. — P. 110—114. — doi:10.1111/j.1365-2265.2006.02694.x. — PMID 17201809.

Ссылки

Эта статья взята у (из) Wikipedia. Текст лицензируется по Creative Commons - Attribution - Sharealike. К медиа файлам могут применятся дополнительные условия.